软件工具分析活检切片中的癌细胞

一种创新的软件工具可以通过提供组织活检诊断见解来促进癌症病理学的发展。该工具名为 METI(形态增强空间转录组分析集成器)，由 MD Anderson 和 Emory 的研究人员开发。

METI 提供了一个平台，可根据活检样本中的细胞外观、组织方式(组织学)以及细胞内活跃的基因来整合数据。它可以识别癌细胞以及其他细胞，例如健康细胞或迁移到肿瘤中的免疫细胞。活检样本中免疫细胞的存在和细胞的空间组织通常对诊断至关重要。

“METI 的主要贡献在于它能够通过整合分子和形态信息准确识别肿瘤细胞和肿瘤微环境的其他成分，”共同资深作者、埃默里医学院人类遗传学助理教授兼基因组学人工智能实验室主任 Jian Hu 博士说。

为了创建 METI，胡博士与 MD 安德森癌症中心的 Linghua Wang 博士及其实验室以及一支经验丰富的病理学家团队合作。他们在《自然通讯》上发表的一篇论文中描述了该软件的性能。该软件在GitHub上可用，具有用户友好的数据可视化界面。

研究人员评估了 METI 对 MD Anderson 肺癌和膀胱癌以及浙江省肿瘤医院胃癌活检样本的表现。胡表示，该软件可以应用于多种癌症类型，因为它依赖于各种癌症共有的基因表达和形态特征。